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在PCR扩增实验中应注意什么
1.引物的质量是保证PCR特异性的关键,引物过长或过短均会使特异性降低,以18~30bp为宜;引物中C+G含量宜在50%左右;引物内部和引物之间不应含有互补序列;引物的碱基顺序与非扩增区域的同源性应小于70%;引物的3’末端与模板DNA一定要配对,但末端没有严格的限制,故引物设计时可在5’末端加上限制性内切酶位点和/或启动密码ATG等;引物合成后必须纯化以去除合成产物中的不完整序列、脱嘌呤产物、碱基修饰链等“杂质”;引物的终浓度一般为0.2~0.5μmol/L,过低会影响反应产量,过高会增加引物二聚或错配的几率。
2.TaqDNA聚合酶具有5’→3’聚合酶活性和5’→3’外切酶活性,但无3’-5’外切酶活性,因此对单核苷酸的错配无校正功能,发生碱基错配的几率为2.1×10-4左右。然而TaqDNA聚合酶的优势在于反应产量高于其他DNA聚合酶。Stratagene推出的PfuDNA聚合酶一直是研究人员心目中最好的高保真酶,而PfuDNA聚合酶经基因工程改造后,新创出的PfuUltra具有更佳的校验活力。数据显示PfuUltraTM高保真DNA聚合酶的平均错配率为PfuDNA聚合酶的1/3,为TaqDNA聚合酶的1/18,是目前保真度最高的PCR酶(保真度=1/错误率)(数据来源:美国冷泉港实验室)。
3.Mg2+浓度也是影响反应效率和特异性的重要因素之一。TaqDNA聚合酶对Mg2+浓度非常敏感,Mg2+可与模板DNA、引物及dNTP等的磷酸根结合,不同反应体系中应适当调整MgCl2的浓度,一般以比dNTP总浓度高出0.5~1.0mmol/L为宜,Mg2+过量能增加非特异扩增。
4.dNTP的浓度过高会增加碱基的错误掺入率,使反应特异性下降;过低则会导致反应速度下降。使用时4种dNTP必须以等当量浓度配制,均衡的dNTP有利于减少错配误差和提高使用效率。
5.温度循环参数中应特别注意复性温度,它决定引物与模板的特异性结合。退火复性温度可根据引物的长度,通过Tm=4(G+C)+2(A+T)计算得到。在Tm允许的范围内,选择较高的退火温度可大大减少引物与模板之间的非特异结合。
6.减低污染的常规措施:①将PCR试剂、PCR产物及其他分子生物学试剂分开放置;②应保持样品制备、PCR反应液配制与PCR产物分析三个工作区的独立性;③使用阳性和阴性对照;④使用最高质量的水配制PCR实验的所有反应试剂;⑤配制好的PCR反应试剂应分成小包装储存,每个包装仅用于单次实验;⑥制备样品、配制试剂及反应液时必须戴手套;⑦实验前一定要认真清洁加样器等。
进入实验室该做哪些防护工作
呼吸防护实验过程中,有些会发生化学反应产生有毒有害蒸气或气体,从而对工作人员造成呼吸道的伤害,这样就需要佩戴个人呼吸防护用品,比较常见的有防毒面具或防毒口罩。
具体需要按现场有毒气体的危害程度来选择,如果毒性较大,建议选择(haigu)防毒面具。眼睛及脸部防护1.防护眼罩或防化眼镜:眼睛及脸部是实验室中最易被事故所伤害的部位,因而对他们的保护尤为重要。实验室工作环境内,涉及到溶液试剂的实验人员必须戴安全防护眼镜。
2.洗眼器:当化学溶剂溅入眼睛后,应立即用使用洗眼器彻底冲洗。冲洗时,应将眼皮撑开,小心地用自来水冲洗数分钟,再用蒸馏水冲,然后去医务室进行治疗。
洗眼器一般可以选用壁挂式洗眼器或便携式洗眼器。
3.面屏:面部防护用具用于保护脸部和喉部。为了防止可能的爆炸及实验产生的物体飞溅造成冲击伤害,可佩戴有机玻璃或聚碳酸酯材质的防护面罩或面屏。
身体防护人员进入实验室都必须穿防化服,其目的是为了防止身体的皮肤和衣着受到化学药品的污染。
防化服最基本的性能就是能够对一般化学药品耐腐蚀,如果是选用的可重复使用的防化服,在使用后还需用相应的溶剂冲洗保存,防止防化服表面附着的化学物质的二次伤害。
手部防护在实验室中为了防止手受到伤害,可根据需要选戴不同类型防护手套。
当接触腐蚀性物质,边缘尖锐的物体(如碎玻璃、木材、金属碎片),过热或过冷的物质时均须戴手套。
化验室对易燃易爆物品应怎样存放
低沸点的化合物、需要低温保存的药品须按要求放入所需的环境(低温冰箱);
避光保存的药品及其所配制的试剂,均应按要求用棕色容器(瓶)保存,或用深色纸包裹。
药品一律放入药品柜内,不得与配制的溶液混在一起放置;
液体药品放置矮柜。固体药品与液体药品分开放置;
酸碱不能混放,氧化剂和还原剂不能混放,如果混合会发生剧烈反应的试剂不能混放,防止可能因为倾倒,破碎等意外原因引发事故;
对于一些常温环境下存放的药品,一定要注意防潮,负责会发生固体结块现象!液体样品结块好像以前只遇到冰醋酸,放在温度高些的地方就能变成液态了;
北方的冬季有点冷,部分实验室的空调一般只制冷,不制热,有一些凝固点和常温偏差不大的试剂,会出现冬天凝固,夏天又变成液体的情况。还要注意的是,试剂瓶一般都是普通玻璃生产的,非常厚,温度变化太剧烈的话容易炸裂。比如,对怕冷怕冻的腐蚀性物品。如受冻结冰的冰醋酸,受冻聚合沉淀的甲醇等,库房温度应保持在15℃左右,冬季要保暖;
硫酸和盐酸都不好保存,虽然都是酸,硫酸应该跟甲酸、乙酸、盐酸分开放置;
甲酸、乙酸、盐酸有强挥发性,应通风良好,把酸雾及时排出;
硫酸具有强氧化性和强脱水性,应该单独放置。
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