今天给各位分享为什么dna电泳的条带很浅的知识,其中也会对电泳条带模糊的解决办法进行解释,如果能碰巧解决你现在面临的问题,别忘了关注本站,现在开始吧!
本文目录
marker条带不清晰原因
1.marker条带出现了降解。请确保在使用过程中避免核酸酶污染;
2.电泳缓冲液陈旧。电泳缓冲液多次使用后,离子浓度降低,pH值上升,缓冲能力减弱,从而影响电泳效果,建议经常更换电泳缓冲液;
3.电泳条件不合适。电泳时电压应不超过20V/cm,温度应低于30℃;
4.marker上样量过多。请根据说明书选用合适上样量;
5.凝胶质量不好。建议使用质量较好的琼脂糖;此外,凝胶凝固不均匀也会导致条带模糊。.
琼脂糖凝胶电泳实验过程
一、操作步骤:
1、电泳方法
一般的核酸检测只需要琼脂糖凝胶电泳就可以;如果需要分辨率高的电泳,特别是只有几个bp的差别应该选择聚丙烯酰胺凝胶电泳;用普通电泳不合适的巨大DNA链应该使用脉冲凝胶电泳。
2、凝胶浓度
对于琼脂糖凝胶电泳,浓度通常在0.5~2%之间,低浓度的用来进行大片段核酸的电泳,高浓度的用来进行小片段分析。低浓度胶易碎,小心操作和使用质量好的琼脂糖是解决办法。
3、缓冲液
常用的缓冲液有TAE和TBE,而TBE比TAE有着更好的缓冲能力。电泳时使用新制的缓冲液可以明显提高电泳效果。
4、电压和温度
电泳时电场强度不应该超过20V/cm,电泳温度应该低于30℃,对于巨大的DNA电泳,温度应该低于15℃。
5、DNA样品的纯度和状态
注意样品中含盐量太高和含杂质蛋白均可以产生条带模糊和条带缺失的现象。乙醇沉淀可以去除多余的盐,用酚可以去除蛋白。
6、DNA的上样
正确的DNA上样量是条带清晰的保证。注意太多的DNA上样量可能导致DNA带型模糊,而太小的DNA上样量则导致带信号弱甚至缺失。
7、Marker的选择
DNA电泳一定要使用DNAMarker或已知大小的正对照DNA来估计DNA片段大小。Marker应该选择在目标片段大小附近ladder较密的,这样对目标片段大小的估计才比较准确。
8、凝胶的染色和观察
实验室常用的核酸染色剂是溴化乙锭(EB),染色效果好,操作方便,但是稳定性差,具有毒性。注意观察凝胶时应根据染料不同使用合适的光源和激发波长,如果激发波长不对,条带则不易观察,出现条带模糊的现象。
二、注意事项:
1、巨大的DNA链用普通电泳可能跑不出胶孔导致缺带。
2、高浓度的胶可能使分子大小相近的DNA带不易分辨,造成条带缺失现象。
3、电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲性能下降,可能使DNA电泳产生条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。
4、如果电泳时电压和温度过高,可能导致出现条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。特别是电压太大可能导致小片段跑出胶而出现缺带现象。
5、变性的DNA样品可能导致条带模糊和缺失,也可能出现不规则的DNA条带迁移。在上样前不要对DNA样品加热,用20mMNaCl缓冲液稀释可以防止DNA变性。
6、太多的DNA上样量可能导致DNA带型模糊,而太小的DNA上样量则导致带信号弱甚至缺失。
为什么dna电泳的条带很浅
1.电泳缓冲液多次使用后,离子浓度较低,pH值上升,缓冲性能下降,可能出现条带模糊和不规则...
2.加样量太多可能导致条带模糊,加样量太少则可能条带弱甚至缺失。
3.电压和温度过高,可能导致条带模糊或迁移。
4.样品中含盐太高和含杂志蛋白均可以产生条带模糊和条带缺失的现象。
琼脂糖凝胶电泳跑成这样是怎么回事
琼脂糖凝胶具有网状结构,网状结构的疏密依靠琼脂糖的浓度。核酸分子在琼脂糖凝胶中电泳时,具有电荷效应和分子筛效应,泳动时受到阻力。
琼脂糖凝胶的浓度需要根据你的目的条带长度来调整,通常在浓度0.5~2%之间。低浓度胶用来进行大片段核酸电泳,高浓度胶用来进行小片段核酸分析。所以琼脂糖浓度影响核酸分子“跑”的速度。
在我们实验室,目的条带一般不超过1kb,我们用的是1%的胶。至于条带模糊不清,弥散,可能是以下原因1)电泳缓冲液多次使用后,离子浓度较低,pH值上升,缓冲性能下降,可能出现条带模糊和不规则迁移的现象。
2)加样量太多可能导致条带模糊,加样量太少则可能条带弱甚至缺失。
3)电压和温度过高,可能导致条带模糊或迁移。
4)样品中含盐太高和含杂志蛋白均可以产生条带模糊和条带缺失的现象。
5)核酸染色剂的稳定性及用量问题。实验室常用的核酸染色剂是溴化乙锭(EB),染色效果好,稳定性差,有毒。在凝胶温度50~60℃时加EB。附之前实验的图,Marker特别淡是因为Marker时间太久了,条带有点模糊,后来换了新的缓冲液就好了很多。就酱,分子生物学研究狗一枚,欢迎探讨指正~
关于本次为什么dna电泳的条带很浅和电泳条带模糊的解决办法的问题分享到这里就结束了,如果解决了您的问题,我们非常高兴。